Stolnica oziroma cerkev Svetega Janeza Krstnika je mogočna cerkev, ki se nahaja na Slomškovem trgu. Okoli Stolne cerkve je bilo včasih mestno pokopališče, kjer so pokopali veliko znamenitih mariborskih družin. Njihovi nagrobniki so danes vzidani v zunanjo steno cerkve. Cerkev je bila zgrajena v 12. stoletju kot romanska stavba. Danes ima gotsko obliko s prezbiterijem iz 14. stoletja. Osrednja cerkvena ladja je iz 15. stoletja. Po vnaprejšnem dogovoru se lahko vzpnete na vrh 57 metrov klasicistično zasnovanega zvonika, ki je iz konca 18. stoletja. V zvoniku visijo štirje zvonovi.
Prezbiterij ali dolgi kor ima klopi iz leta 1771. Na njih so upodobljeni prizori iz življenja Janeza Krstnika, ki so delo rezbarja Jožefa Holzingerja. Tu lahko vidite tudi grobnico mariborskih škofov, kip blaženega škofa Slomška in škofovo katedralo iz leta 1890. Škof Anton Martin Slomšek je leta 1859 preselil sedež lavantinske škofije v Maribor. V cerkvi Svetega Janeza Krstnika imajo čudovit prostor za koncerte in orgle iz leta 1981. Prižnica je delo neznanega avtorja in je iz leta 1670. Stropne freske so delo graškega slikarja Adama Molka iz leta 1775 in predstavljajo Povišanje svetega križa.
Oltar Marije Pomočnice izhaja iz leta 1699. Lestenci iz leta 1686, ki visijo s stropa osrednje ladje, so bili verjetno dar zlatarskega, pekovskega in mesarskega mestnega ceha. V tem delu lahko vidite tudi sliko krsta v Jordanu in kopijo Rubensovega snemanja s križa.