Šmarje so večji razpotegnjen kraj, ki se nahaja sredi Šavrinskega gričevja. Vas stoji na slemenu med vrhovoma Grintovcem na zahodu in Poljanami na vzhodu. Ime izvira iz Sancta Maria, kot se je vas nekdaj imenovala.
Župna cerkev Brezmadežne Matere božje se nahaja v samem starem vaškem jedru. Verjetno je zrasla na temeljih predromanske cerkve iz 11. stoletja. V začetku 13. stoletja so pričeli cerkveni kompleks obnavljati in širiti. Leta 1222 je prenovljeno cerkev posvetil koprski škof Beato Assalone, na kar spominja kamnita plošča, vzidana na zunanji, južni strani cerkve. Leta 1730 je bila cerkev v času župana Antona Rojca znova rekostruirana in razširjena, vendar je sedanjo podobo dobila šele leta 1925, ko so jo predelali po načrtih Koprčana Giovannija Mayerja. Še enkrat je bila tako posvečena 8. decembra 1926. Cerkvena notranjščina je preprosta in skromna, saj je bila cerkev leta 1831 oropana. Edina dragocenost iz nekdanje bogate zapuščine, ki se hrani v župnijskem arhivu, je glagolski misal iz leta 1631, ki spominja na nekdanje slovansko bogoslužje, odpravljeno leta 1833. Kropilnik, ki ga je izdelal kipar Norbedo iz Kopra, izvira iz leta 1933. Enoladijski cerkveni prostor zaključuje raven strop in poligonalni prezbiterij s kupolo nad oltarno mizo. Že leta 1700 je škof Paolo Naldini v svojem Cerkvenem krajepisu poročal, da notranjost krasi pet lepih oltarjev. V okoli 18 metrov visokem zvoniku, ki je grajen iz klesancev peščenjaka, kot je tudi sama cerkev, je vzidana ura in tranzena oziroma kamnito okno iz 9. stoletja, ostanek najstarejše cerkve na tem področju.
Poleg župne cerkve Brezmadežne device Marije so bile v vasi še tri cerkve, od katerih je ostala le cerkvica sv. Antona puščavnika na pokopališču, ki jo je leta 1488 posvetil koprski škof Giacomo Valaresso.